Yhteistyö paikallisella tasolla on tärkeää, joten paikallisosastoja kannustetaan osallistumaan kuntansa verkostoyhteistyöhön. Yhteistyöprojekteihin osallistutaan silloin, kun yhdistyksen rooli työryhmässä on selkeä. Yhteistyötä tehdään esim. Terveyden Edistämisen Keskuksen ja sen jäsenjärjestöjen, KEPAn, SPR:n, Nuorten Akatemian, STAKESin ja Nimettömien narkomaanien kanssa. YAD ry jatkaa yhteistyötään myös muiden päihdealan järjestöjen, hoitopaikkojen, kuntien nuoriso- ja sosiaalityön, seurakuntien, koulujen, oppilaitosten sekä terveydenhuoltohenkilöstön kanssa. Järjestöyhteistyössä valtakunnallisesti keskeisiä yhteistyömuotoja ovat YK:n huumeiden vastaisen päivän tapahtuman järjestäminen kesäkuussa sekä järjestöjen huumeohjelman suunnittelu ja toteutus.

Yhdistys on ollut mukana perustamassa Jyväskylän seudun päihdepalvelusäätiötä, jonka kautta YAD ry pystyy vaikuttamaan alueelliseen päihdetyöhön. Säätiö on aloittanut toimintansa vuoden 2002 alusta. YAD ry:n osuus tässä hankkeessa on ennen kaikkea tuoda ehkäisevän huumetyön osaamista laajempaan käyttöön. Tampereella YAD ry on aktiivisesti osallistunut Tampere 2000 verkoston toimintaan, erityisesti vapaaehtoistyön kehittämistoiminnassa.